Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Borcs6Q9D6W8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Borcs6Q9D6W8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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