Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms