Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ptp4a3Q9D658 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptp4a3Q9D658 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptp4a3Q9D658 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptp4a3Q9D658 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms