Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al3Q9D4U4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al3Q9D4U4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms