Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy3Q9D394 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms