Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms