Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tmed11Q9D2R4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tmed11Q9D2R4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tmed11Q9D2R4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tmed11Q9D2R4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmed11Q9D2R4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmed11Q9D2R4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmed11Q9D2R4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmed11Q9D2R4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tmed11Q9D2R4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tmed11Q9D2R4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed11Q9D2R4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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