Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Pramef12Q9D2F1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pramef12Q9D2F1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pramef12Q9D2F1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pramef12Q9D2F1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pramef12Q9D2F1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pramef12Q9D2F1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pramef12Q9D2F1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pramef12Q9D2F1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef12Q9D2F1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms