Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syf2Q9D198 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms