Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ift27Q9D0P8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms