Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms