Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis12Q9CY25 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms