Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmed5Q9CXE7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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