Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NubplQ9CWD8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms