Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms