Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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