Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mrpl35Q9CQL6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl35Q9CQL6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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