Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms