Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl11Q9CQF0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms