Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab5aQ9CQD1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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