Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b1Q99NB9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms