Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp26Q99MX1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp26Q99MX1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp26Q99MX1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp26Q99MX1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp26Q99MX1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms