Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrrtQ99MR6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrrtQ99MR6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms