Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nmd3Q99L48 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nmd3Q99L48 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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