Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ciao1Q99KN2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ciao1Q99KN2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms