Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctu1Q99J10 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms