Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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