Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pde6cQ91ZQ1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Pde6cQ91ZQ1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Pde6cQ91ZQ1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Pde6cQ91ZQ1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Pde6cQ91ZQ1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Pde6cQ91ZQ1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Pde6cQ91ZQ1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Pde6cQ91ZQ1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Pde6cQ91ZQ1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pde6cQ91ZQ1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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