Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf6Q91YR7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf6Q91YR7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms