Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csde1Q91W50 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms