Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thoc3Q8VE80 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms