Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39cQ8VE09 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms