Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam20bQ8VCS3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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