Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms1Q8VCQ6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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