Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobrQ8VBT6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApobrQ8VBT6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms