Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms