Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms