Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms