Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r200Q8R281 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms