Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CipcQ8R0W1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CipcQ8R0W1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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