Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms