Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Vmn1r188Q8K3N2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r188Q8K3N2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r188Q8K3N2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vmn1r188Q8K3N2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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