Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pacs1Q8K212 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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