Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms