Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms