Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne4Q8CII8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms