Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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