Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl11Q8CE33 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms