Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CD60 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CD60 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CD60 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CD60 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CD60 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CD60 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CD60 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CD60 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CD60 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CD60 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms