Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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